Schüler von Marie Claire Alain und Gaston Litaize in Paris und von Ludwig Doerr in Saarbrücken, setzt danach seine Ausbildung mit Anton Heiller (Wien) und Luigi Ferdinando Tagliavini (Bologna) fort. 1973 gewinnt er den 3. Preis beim internationalen Orgelwettbewerb in Brügge. Von der Musikkritik wegen seiner Virtuosität, der Klangtreue seiner Interpretationen sowie der Ausdrucksstärke beim Gebrauch der Register geschätzt, verwirklicht Bernhard Marx Aufnahmen für Radio- und Fernsehsender, spielt Tonträger ein und gibt Konzerte in ganz Europa, den USA, Kanada, Mexiko, Lateinamerika sowie in Japan. Seit 1972 ist er Titularorganist der Johanneskirche in Freiburg im Breisgau sowie Professor für Orgelmusik an der Pädagogischen Hochschule dieser Stadt. 1976 erhält er mit Ludwig Doerr das Diplom als Konzertmeister („Prix d’excellence“). Seit 1979 ist er Professor an der Hochschule für Kirchenmusik Rottenburg, seit 1997 künstlerischer Leiter des berühmten internationalen Kirchenmusikfestivals im Dom zu St. Blasien (Deutschland) und seit 2011 Titularorganist am Dom St. Blasien.